| 18. Round | 08/12/2024 | Arzignano Valchiampo | - | Atalanta II | 3:1 | ||||
| 17. Round | 11/12/2024 | Atalanta II | - | Clodiense SSD | 2:1 | ||||
| 19. Round | 14/12/2024 | Atalanta II | - | Calcio Lecco 1912 | 5:2 | ||||
| 20. Round | 20/12/2024 | Alcione Milano | - | Atalanta II | 0:1 | ||||
| 21. Round | 04/01/2025 | Atalanta II | - | Novara Calcio | 0:0 | ||||
| 22. Round | 11/01/2025 | Trento Calcio 1921 | - | Atalanta II | 2:2 | ||||
| 23. Round | 18/01/2025 | Atalanta II | - | US Triestina | 3:1 |  |
|||
| 24. Round | 25/01/2025 | Atalanta II | - | FC Lumezzane | 0:1 | ||||
| 25. Round | 02/02/2025 | US Pergolettese | - | Atalanta II | 3:1 | ||||
| 26. Round | 08/02/2025 | Atalanta II | - | Virtus Verona | 0:3 | ||||
| 35. Round | 06/04/2025 | Caldiero Terme | - | Atalanta II | 1:1 | ||||
| 36. Round | 12/04/2025 | Clodiense SSD | - | Atalanta II | 1:3 |
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