| 2. Round | 01/09/2024 | Novara Calcio | - | Atalanta II | 0:3 | ||||
| 3. Round | 07/09/2024 | Atalanta II | - | Trento Calcio 1921 | 1:1 | ||||
| 4. Round | 15/09/2024 | US Triestina | - | Atalanta II | 1:5 | ||||
| 5. Round | 22/09/2024 | FC Lumezzane | - | Atalanta II | 2:1 | ||||
| 6. Round | 25/09/2024 | Atalanta II | - | US Pergolettese | 5:1 | ||||
| 8. Round | 04/10/2024 | Atalanta II | - | Giana Erminio | 1:3 |  |
|||
| 10. Round | 19/10/2024 | Atalanta II | - | AC Renate | 4:0 |  |
|||
| 11. Round | 26/10/2024 | L.R. Vicenza | - | Atalanta II | 3:0 | ||||
| 12. Round | 29/10/2024 | Atalanta II | - | Pro Vercelli | 2:0 | ||||
| 16. Round | 23/11/2024 | Atalanta II | - | Caldiero Terme | 2:0 | |
|||
| 30. Round | 09/03/2025 | Atalanta II | - | L.R. Vicenza | 2:2 | ||||
| 31. Round | 13/03/2025 | Pro Vercelli | - | Atalanta II | 0:0 | ||||
| 34. Round | 30/03/2025 | Atalanta II | - | Calcio Padova | 1:1 | ||||
| 33. Round | 02/04/2025 | Aurora Pro Patria | - | Atalanta II | 1:2 | ||||
| 35. Round | 06/04/2025 | Caldiero Terme | - | Atalanta II | 1:1 | ||||
| 36. Round | 12/04/2025 | Clodiense SSD | - | Atalanta II | 1:3 | ||||
| 37. Round | 18/04/2025 | Atalanta II | - | Arzignano Valchiampo | 1:3 |
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