| 1. Round | 28/08/2016 | Quilmes | - | Newell's Old Boys | 0:1 |  |
|||
| 3. Round | 17/09/2016 | Quilmes | - | Independiente | 1:1 | ||||
| 4. Round | 25/09/2016 | Boca Juniors | - | Quilmes | 4:1 | ||||
| 6. Round | 18/10/2016 | Unión de Santa Fe | - | Quilmes | 1:1 | ||||
| 7. Round | 22/10/2016 | Quilmes | - | Lanús | 1:0 | ||||
| 8. Round | 29/10/2016 | Belgrano de Córdoba | - | Quilmes | 0:0 | ||||
| 9. Round | 05/11/2016 | Quilmes | - | Godoy Cruz | 1:0 | ||||
| 10. Round | 20/11/2016 | Quilmes | - | Aldosivi | 1:0 | ||||
| 11. Round | 26/11/2016 | Tigre | - | Quilmes | 3:0 | ||||
| 12. Round | 03/12/2016 | Quilmes | - | Sarmiento de Junín | 1:3 | ||||
| 20. Round | 16/04/2017 | Quilmes | - | Colón de Santa Fe | 0:1 | ||||
| 27. Round | 05/06/2017 | Quilmes | - | Patronato de Paraná | 0:1 |  |
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