| 2. Round | 19/08/2023 | FC Ingolstadt 04 [Youth] | - | 1. FSV Mainz 05 [Youth] | 0:0 | ||||
| 3. Round | 23/08/2023 | Karlsruher SC [Youth] | - | FC Ingolstadt 04 [Youth] | 1:3 |  |
|||
| 4. Round | 27/08/2023 | FC Ingolstadt 04 [Youth] | - | Eintracht Frankfurt [Youth] | 0:1 | ||||
| 6. Round | 24/09/2023 | FC Ingolstadt 04 [Youth] | - | VfB Stuttgart [Youth] | 1:2 | ||||
| 7. Round | 29/09/2023 | 1. FC Heidenheim 1846 [Youth] | - | FC Ingolstadt 04 [Youth] | 3:4 | ||||
| 22. Round | 12/04/2024 | FC Ingolstadt 04 [Youth] | - | 1. FC Nürnberg [Youth] | 2:1 | ||||
| 23. Round | 21/04/2024 | Bayern München [Youth] | - | FC Ingolstadt 04 [Youth] | 0:1 | ||||
| 24. Round | 28/04/2024 | FC Ingolstadt 04 [Youth] | - | 1. FC Kaiserslautern [Youth] | 3:0 | ||||
| 25. Round | 04/05/2024 | FC Ingolstadt 04 [Youth] | - | FC Augsburg [Youth] | 2:1 | ||||
| 26. Round | 11/05/2024 | SpVgg Greuther Fürth [Youth] | - | FC Ingolstadt 04 [Youth] | 0:2 |
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