| 1. Round | 16/07/2015 | Jahn Regensburg | - | Viktoria Aschaffenburg | 3:2 | ||||
| 2. Round | 21/07/2015 | FC Ingolstadt 04 II | - | Jahn Regensburg | 1:3 |  |
|||
| 3. Round | 25/07/2015 | SpVgg Unterhaching | - | Jahn Regensburg | 0:2 | ||||
| 7. Round | 22/08/2015 | FV Illertissen | - | Jahn Regensburg | 1:3 | ||||
| 8. Round | 28/08/2015 | Jahn Regensburg | - | SpVgg Bayreuth | 1:1 | ||||
| 16. Round | 23/10/2015 | Jahn Regensburg | - | SpVgg Greuther Fürth II | 5:0 | ||||
| 19. Round | 15/11/2015 | Jahn Regensburg | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:2 | |
|||
| 20. Round | 22/11/2015 | Jahn Regensburg | - | SpVgg Unterhaching | 2:1 | ||||
| 21. Round | 27/11/2015 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Jahn Regensburg | 2:1 | ||||
| 22. Round | 27/02/2016 | Jahn Regensburg | - | FC Augsburg II | 3:2 | ||||
| 24. Round | 11/03/2016 | Jahn Regensburg | - | FV Illertissen | 4:0 | ||||
| 28. Round | 08/04/2016 | Jahn Regensburg | - | TSV 1896 Rain | 1:0 | ||||
| 23. Round | 12/04/2016 | FC Amberg | - | Jahn Regensburg | 0:0 | ||||
| 33. Round | 16/05/2016 | SpVgg Greuther Fürth II | - | Jahn Regensburg | 1:2 | ||||
| 34. Round | 21/05/2016 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Nürnberg II | 0:1 |
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