| 15. Round | 23/11/2013 | 1. FC Köln | - | FC Ingolstadt 04 | 0:1 | ||||
| 18. Round | 15/12/2013 | Erzgebirge Aue | - | FC Ingolstadt 04 | 0:0 | ||||
| 19. Round | 23/12/2013 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:2 | ||||
| 26. Round | 22/03/2014 | FC St. Pauli | - | FC Ingolstadt 04 | 0:0 | ||||
| 27. Round | 25/03/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | VfL Bochum | 3:0 | ||||
| 28. Round | 28/03/2014 | Fortuna Düsseldorf | - | FC Ingolstadt 04 | 0:0 | ||||
| 29. Round | 07/04/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:0 | ||||
| 30. Round | 11/04/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | SC Paderborn 07 | 1:2 | ||||
| 31. Round | 20/04/2014 | VfR Aalen | - | FC Ingolstadt 04 | 0:0 | ||||
| 32. Round | 25/04/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Köln | 1:1 | ||||
| 33. Round | 04/05/2014 | SV Sandhausen | - | FC Ingolstadt 04 | 0:2 | ||||
| 34. Round | 11/05/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | Energie Cottbus | 2:0 |
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