| 3. Round | 29/07/2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | VfB Eichstätt | 5:2 | ||||
| 4. Round | 04/08/2023 | DJK Gebenbach | - | FC Ingolstadt 04 II | 3:2 |  |
|||
| 6. Round | 15/08/2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | Würzburger FV | 3:2 | ||||
| 7. Round | 19/08/2023 | SpVgg Hankofen-Hailing | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:4 | ||||
| 8. Round | 25/08/2023 | TSV Neudrossenfeld | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:2 | ||||
| 10. Round | 05/09/2023 | DJK Ammerthal | - | FC Ingolstadt 04 II | 3:1 | ||||
| 17. Round | 14/10/2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | ASV Neumarkt | 3:1 | ||||
| 18. Round | 21/10/2023 | SV Donaustauf | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:3 | ||||
| 19. Round | 28/10/2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | ASV Cham | 0:0 | ||||
| 20. Round | 03/11/2023 | TSV Kornburg | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:3 |
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