2. Round 08/08/1999 Preußen Münster - Bayer Leverkusen II 3:3
3. Round 11/08/1999 SC 07 Idar-Oberstein - Preußen Münster 1:1 Goal yellow card
4. Round 15/08/1999 Preußen Münster - Rot-Weiss Essen 1:0 Goal
1. Round 18/08/1999 FK Pirmasens - Preußen Münster 0:0 yellow card
5. Round 22/08/1999 1. FC Saarbrücken - Preußen Münster 3:0
6. Round 29/08/1999 Preußen Münster - SG Wattenscheid 09 2:3
7. Round 05/09/1999 Sportfreunde Siegen - Preußen Münster 2:0
8. Round 12/09/1999 Preußen Münster - 1. FC Kaiserslautern II 1:2
10. Round 26/09/1999 Preußen Münster - LR Ahlen 0:2
18. Round 28/11/1999 Preußen Münster - FSV Salmrohr 3:0
19. Round 05/12/1999 SC Verl - Preußen Münster 4:0
20. Round 15/12/1999 Preußen Münster - FK Pirmasens 2:0
21. Round 19/12/1999 Bayer Leverkusen II - Preußen Münster 0:1
22. Round 06/02/2000 Preußen Münster - SC 07 Idar-Oberstein 2:0
23. Round 12/02/2000 Rot-Weiss Essen - Preußen Münster 4:1
24. Round 20/02/2000 Preußen Münster - 1. FC Saarbrücken 1:0 yellow card
25. Round 27/02/2000 SG Wattenscheid 09 - Preußen Münster 0:0
26. Round 07/03/2000 Preußen Münster - Sportfreunde Siegen 2:1 Goal
27. Round 12/03/2000 1. FC Kaiserslautern II - Preußen Münster 0:1
29. Round 26/03/2000 LR Ahlen - Preußen Münster 3:0
30. Round 02/04/2000 Preußen Münster - Eintracht Trier 0:1
32. Round 14/04/2000 Preußen Münster - SV 07 Elversberg 2:1 GoalGoal yellow card
31. Round 19/04/2000 SC Paderborn 07 - Preußen Münster 3:1
33. Round 24/04/2000 Borussia Dortmund II - Preußen Münster 1:0
35. Round 07/05/2000 Fortuna Düsseldorf - Preußen Münster 2:3
36. Round 14/05/2000 Preußen Münster - KFC Uerdingen 05 2:2 Goal
37. Round 21/05/2000 FSV Salmrohr - Preußen Münster 2:1
38. Round 28/05/2000 Preußen Münster - SC Verl 4:1 GoalGoal