| 2. Round | 25/07/2012 | SV Heimstetten | - | Eintracht Bamberg | 0:0 | ||||
| 3. Round | 28/07/2012 | SV Heimstetten | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 7. Round | 15/08/2012 | TSV 1896 Rain | - | SV Heimstetten | 1:0 | ||||
| 9. Round | 24/08/2012 | Würzburger Kickers | - | SV Heimstetten | 1:1 | ||||
| 10. Round | 31/08/2012 | SV Heimstetten | - | FC Augsburg II | 1:1 | ||||
| 12. Round | 15/09/2012 | SV Heimstetten | - | FV Illertissen | 0:0 | ||||
| 13. Round | 21/09/2012 | SV Heimstetten | - | TSV 1860 München II | 1:0 | ||||
| 14. Round | 28/09/2012 | SC Eltersdorf | - | SV Heimstetten | 2:7 |  |
|||
| 15. Round | 02/10/2012 | SV Heimstetten | - | FC Memmingen | 1:0 | ||||
| 16. Round | 06/10/2012 | FC Ingolstadt 04 II | - | SV Heimstetten | 2:2 |
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