| 1. Round | 07/08/2016 | Brandenburger SC Süd | - | BSG Wismut Gera | 1:1 | ||||
| 2. Round | 13/08/2016 | Union Sandersdorf | - | BSG Wismut Gera | 2:0 | ||||
| 3. Round | 26/08/2016 | FC Carl Zeiss Jena II | - | BSG Wismut Gera | 1:3 |  |
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| 4. Round | 11/09/2016 | BSG Wismut Gera | - | FC Einheit Rudolstadt | 0:0 | ||||
| 5. Round | 17/09/2016 | Askania Bernburg | - | BSG Wismut Gera | 2:2 | ||||
| 6. Round | 25/09/2016 | BSG Wismut Gera | - | BSG Chemie Leipzig | 0:2 |  |
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| 8. Round | 16/10/2016 | VFC Plauen | - | BSG Wismut Gera | 3:0 | |
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| 9. Round | 23/10/2016 | Germania Halberstadt | - | BSG Wismut Gera | 2:0 | ||||
| 10. Round | 30/10/2016 | BSG Wismut Gera | - | SV SCHOTT Jena | 1:0 | ||||
| 11. Round | 05/11/2016 | SSV Markranstädt | - | BSG Wismut Gera | 2:3 | |
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| 12. Round | 19/11/2016 | BSG Wismut Gera | - | Bischofswerdaer FV | 0:1 | ||||
| 14. Round | 04/12/2016 | BSG Wismut Gera | - | Inter Leipzig | 2:0 | ||||
| 15. Round | 10/12/2016 | FSV Barleben | - | BSG Wismut Gera | 1:3 | |
|||
| 16. Round | 19/02/2017 | BSG Wismut Gera | - | Brandenburger SC Süd | 1:2 | ||||
| 17. Round | 26/02/2017 | BSG Wismut Gera | - | Union Sandersdorf | 4:1 |
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