| 1. Round | 30/07/2006 | TSV Aindling | - | 1. FC Bad Kötzting | 3:3 | ||||
| 2. Round | 02/08/2006 | TSV Großbardorf | - | TSV Aindling | 2:1 | ||||
| 9. Round | 02/09/2006 | 1. FC Nürnberg II | - | TSV Aindling | 2:0 | ||||
| 18. Round | 05/11/2006 | TSV Aindling | - | SpVgg Greuther Fürth II | 3:2 | ||||
| 19. Round | 11/11/2006 | SpVgg Weiden | - | TSV Aindling | 1:0 | ||||
| 20. Round | 18/11/2006 | 1. FC Bad Kötzting | - | TSV Aindling | 0:3 | ||||
| 21. Round | 26/11/2006 | TSV Aindling | - | TSV Großbardorf | 0:2 | ||||
| 22. Round | 02/12/2006 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | TSV Aindling | 0:3 | ||||
| 23. Round | 10/12/2006 | TSV Aindling | - | FC Memmingen | 0:0 | ||||
| 33. Round | 28/04/2007 | Jahn Regensburg | - | TSV Aindling | 2:0 |
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