| 1. Round | 31/07/2016 | FC Schönberg 95 | - | Berliner AK 07 | 3:0 |  |
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| 4. Round | 13/08/2016 | Berliner AK 07 | - | ZFC Meuselwitz | 1:0 | ||||
| 7. Round | 18/09/2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | Berliner AK 07 | 3:0 | ||||
| 8. Round | 25/09/2016 | Berliner AK 07 | - | Union Fürstenwalde | 3:2 | ||||
| 10. Round | 16/10/2016 | Berliner AK 07 | - | SV Babelsberg 03 | 2:0 |  |
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| 11. Round | 23/10/2016 | Berliner AK 07 | - | Hertha BSC II | 2:0 | ||||
| 14. Round | 18/11/2016 | Wacker Nordhausen | - | Berliner AK 07 | 1:2 | ||||
| 15. Round | 27/11/2016 | Berliner AK 07 | - | FC Oberlausitz | 0:1 | ||||
| 16. Round | 04/12/2016 | 1. FC Lok Leipzig | - | Berliner AK 07 | 1:4 | ||||
| 17. Round | 11/12/2016 | Berliner AK 07 | - | RB Leipzig II | 3:5 | ||||
| 21. Round | 19/02/2017 | ZFC Meuselwitz | - | Berliner AK 07 | 0:1 | |
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| 22. Round | 26/02/2017 | Berliner AK 07 | - | VfB Auerbach | 1:1 | ||||
| 23. Round | 05/03/2017 | FSV Budissa Bautzen | - | Berliner AK 07 | 1:4 | ||||
| 24. Round | 12/03/2017 | Berliner AK 07 | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:3 | |
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| 25. Round | 19/03/2017 | Union Fürstenwalde | - | Berliner AK 07 | 4:1 |
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