| 1. Round | 06/08/2005 | 1. FC Köln | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:0 |  |
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| 2. Round | 14/08/2005 | VfB Stuttgart | - | 1. FC Köln | 2:3 | |
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| 3. Round | 27/08/2005 | 1. FC Köln | - | 1. FC Kaiserslautern | 2:3 | |
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| 5. Round | 17/09/2005 | 1. FC Köln | - | Bor. Mönchengladbach | 2:1 | ||||
| 9. Round | 16/10/2005 | 1. FC Köln | - | Hannover 96 | 1:4 | ||||
| 17. Round | 17/12/2005 | Arminia Bielefeld | - | 1. FC Köln | 3:2 |  |
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| 18. Round | 28/01/2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | 1. FC Köln | 4:2 | ||||
| 19. Round | 04/02/2006 | 1. FC Köln | - | VfB Stuttgart | 0:0 | ||||
| 20. Round | 07/02/2006 | 1. FC Kaiserslautern | - | 1. FC Köln | 2:2 | ||||
| 21. Round | 12/02/2006 | 1. FC Köln | - | Borussia Dortmund | 0:0 | ||||
| 24. Round | 04/03/2006 | Hertha BSC | - | 1. FC Köln | 2:4 | ||||
| 25. Round | 11/03/2006 | 1. FC Köln | - | 1. FC Nürnberg | 3:4 | ||||
| 26. Round | 18/03/2006 | Hannover 96 | - | 1. FC Köln | 1:0 | ||||
| 27. Round | 25/03/2006 | 1. FC Köln | - | Eintracht Frankfurt | 1:1 | |
|||
| 30. Round | 15/04/2006 | FC Schalke 04 | - | 1. FC Köln | 1:1 | ||||
| 32. Round | 02/05/2006 | 1. FC Köln | - | Hamburger SV | 0:1 | ||||
| 33. Round | 06/05/2006 | Werder Bremen | - | 1. FC Köln | 6:0 | ||||
| 34. Round | 13/05/2006 | 1. FC Köln | - | Arminia Bielefeld | 4:2 |
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