| 1. Round | 22/07/2017 | Rot-Weiß Erfurt | - | Preußen Münster | 1:1 |  |
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| 2. Round | 29/07/2017 | Preußen Münster | - | SV Meppen | 3:0 | ||||
| 3. Round | 02/08/2017 | Würzburger Kickers | - | Preußen Münster | 0:1 | ||||
| 4. Round | 05/08/2017 | Preußen Münster | - | Werder Bremen II | 0:1 | ||||
| 5. Round | 19/08/2017 | Preußen Münster | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 7. Round | 08/09/2017 | Preußen Münster | - | FSV Zwickau | 0:2 | ||||
| 9. Round | 20/09/2017 | Preußen Münster | - | VfR Aalen | 1:1 | ||||
| 12. Round | 14/10/2017 | SpVgg Unterhaching | - | Preußen Münster | 1:0 | ||||
| 14. Round | 29/10/2017 | SV Wehen Wiesbaden | - | Preußen Münster | 6:2 | ||||
| 18. Round | 02/12/2017 | Sportfreunde Lotte | - | Preußen Münster | 0:0 | ||||
| 21. Round | 21/01/2018 | SV Meppen | - | Preußen Münster | 2:0 | ||||
| 22. Round | 26/01/2018 | Preußen Münster | - | Würzburger Kickers | 1:0 | ||||
| 20. Round | 30/01/2018 | Preußen Münster | - | Rot-Weiß Erfurt | 5:0 | ||||
| 23. Round | 03/02/2018 | Werder Bremen II | - | Preußen Münster | 2:4 | |
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| 24. Round | 10/02/2018 | 1. FC Magdeburg | - | Preußen Münster | 3:1 |
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