| 25. Round | 15/03/2025 | FC Ingolstadt 04 II | - | DJK Ammerthal | 2:1 | ||||
| 26. Round | 22/03/2025 | ASV Neumarkt | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:2 | ||||
| 27. Round | 29/03/2025 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV Kornburg | 3:0 | ||||
| 28. Round | 05/04/2025 | DJK Gebenbach | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:6 | ||||
| 30. Round | 19/04/2025 | Jahn Regensburg II | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:1 | ||||
| 32. Round | 02/05/2025 | TSV Neudrossenfeld | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:2 |
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