| 17. Round | 05/11/2016 | TSB Flensburg | - | VfR Neumünster | 1:2 | ||||
| 18. Round | 12/11/2016 | VfR Neumünster | - | NTSV Strand 08 | 1:0 | ||||
| 20. Round | 27/11/2016 | VfR Neumünster | - | Holstein Kiel II | 2:1 | ||||
| 23. Round | 05/03/2017 | SV Frisia 03 | - | VfR Neumünster | 2:1 | ||||
| 24. Round | 12/03/2017 | VfR Neumünster | - | Flensburg 08 | 2:2 | ||||
| 26. Round | 26/03/2017 | VfR Neumünster | - | Concordia Schönkirchen | 3:0 | ||||
| 28. Round | 09/04/2017 | VfR Neumünster | - | SV Eutin 08 | 0:0 | ||||
| 19. Round | 12/04/2017 | PSV Union Neumünster | - | VfR Neumünster | 0:3 | ||||
| 34. Round | 15/04/2017 | TuS Hartenholm | - | VfR Neumünster | 0:3 | ||||
| 22. Round | 17/04/2017 | TSV Altenholz | - | VfR Neumünster | 1:2 | ||||
| 29. Round | 22/04/2017 | Heider SV | - | VfR Neumünster | 4:1 | ||||
| 30. Round | 29/04/2017 | TSV Schilksee | - | VfR Neumünster | 2:3 | ||||
| 25. Round | 03/05/2017 | SV Todesfelde | - | VfR Neumünster | 1:1 | ||||
| 31. Round | 07/05/2017 | VfR Neumünster | - | Kilia Kiel | 5:0 | ||||
| 32. Round | 14/05/2017 | TSV Lägerdorf | - | VfR Neumünster | 3:0 |  |
|||
| 33. Round | 20/05/2017 | VfR Neumünster | - | TSB Flensburg | 1:3 |  |
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