| 1. Round | 05/08/2011 | TSV 1860 München II | - | Eintracht Frankfurt II | 0:1 | ||||
| 2. Round | 12/08/2011 | Eintracht Frankfurt II | - | 1899 Hoffenheim II | 2:1 | ||||
| 5. Round | 02/09/2011 | SC Pfullendorf | - | Eintracht Frankfurt II | 1:3 | ||||
| 6. Round | 06/09/2011 | Eintracht Frankfurt II | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:1 | ||||
| 7. Round | 11/09/2011 | Stuttgarter Kickers | - | Eintracht Frankfurt II | 3:2 |  |
|||
| 9. Round | 25/09/2011 | Bayern München II | - | Eintracht Frankfurt II | 1:2 | ||||
| 10. Round | 30/09/2011 | Eintracht Frankfurt II | - | Karlsruher SC II | 0:1 | ||||
| 16. Round | 04/11/2011 | FC Memmingen | - | Eintracht Frankfurt II | 2:4 | ||||
| 17. Round | 11/11/2011 | Eintracht Frankfurt II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:0 | ||||
| 18. Round | 18/11/2011 | Eintracht Frankfurt II | - | TSV 1860 München II | 2:0 | ||||
| 21. Round | 10/12/2011 | Hessen Kassel | - | Eintracht Frankfurt II | 3:2 | |
|||
| 23. Round | 10/03/2012 | FC Ingolstadt 04 II | - | Eintracht Frankfurt II | 0:1 | ||||
| 25. Round | 24/03/2012 | 1. FC Nürnberg II | - | Eintracht Frankfurt II | 4:0 | ||||
| 26. Round | 01/04/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | Bayern München II | 2:1 |
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