| 1. Round | 24/07/2021 | FC Gundelfingen | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:1 | ||||
| 7. Round | 18/08/2021 | Jahn Regensburg II | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:0 | ||||
| 8. Round | 21/08/2021 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV Schwaben Augsburg | 3:1 |  |
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| 9. Round | 27/08/2021 | FC Ismaning | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:2 |  |
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| 11. Round | 04/09/2021 | FC Ingolstadt 04 II | - | FC Deisenhofen | 1:1 | ||||
| 12. Round | 12/09/2021 | TSV Schwabmünchen | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:3 | |
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| 13. Round | 15/09/2021 | FC Ingolstadt 04 II | - | SV Donaustauf | 2:3 | ||||
| 14. Round | 18/09/2021 | Türkspor Augsburg | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:3 | ||||
| 15. Round | 25/09/2021 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV Wasserburg | 2:2 | ||||
| 16. Round | 01/10/2021 | VfB Hallbergmoos | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:3 | ||||
| 17. Round | 09/10/2021 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV 1865 Dachau | 4:0 | |
|||
| 26. Round | 25/02/2022 | FC Ingolstadt 04 II | - | Jahn Regensburg II | 2:2 |
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