1. Round 16/08/1998 Hertha BSC - Werder Bremen 1:0
2. Round 21/08/1998 Werder Bremen - 1. FC Nürnberg 2:3
3. Round 08/09/1998 VfL Bochum - Werder Bremen 2:0
4. Round 12/09/1998 Werder Bremen - Bayer Leverkusen 2:2
5. Round 19/09/1998 VfL Wolfsburg - Werder Bremen 2:4
6. Round 26/09/1998 Werder Bremen - Bayern München 0:1
7. Round 03/10/1998 Hansa Rostock - Werder Bremen 2:1
8. Round 17/10/1998 Werder Bremen - SC Freiburg 2:3
9. Round 23/10/1998 Hamburger SV - Werder Bremen 1:1
10. Round 31/10/1998 Werder Bremen - MSV Duisburg 1:1
14. Round 20/11/1998 Eintracht Frankfurt - Werder Bremen 0:2
12. Round 24/11/1998 FC Schalke 04 - Werder Bremen 1:2
15. Round 28/11/1998 Werder Bremen - TSV 1860 München 4:1
16. Round 08/12/1998 Bor. Mönchengladbach - Werder Bremen 0:1
17. Round 12/12/1998 Werder Bremen - VfB Stuttgart 2:2
21. Round 07/03/1999 Bayer Leverkusen - Werder Bremen 2:0
23. Round 20/03/1999 Bayern München - Werder Bremen 1:0
24. Round 03/04/1999 Werder Bremen - Hansa Rostock 0:3
25. Round 09/04/1999 SC Freiburg - Werder Bremen 0:2
26. Round 13/04/1999 Werder Bremen - Hamburger SV 0:0
27. Round 17/04/1999 MSV Duisburg - Werder Bremen 2:0
28. Round 23/04/1999 Borussia Dortmund - Werder Bremen 2:1
30. Round 04/05/1999 1. FC Kaiserslautern - Werder Bremen 4:0
31. Round 07/05/1999 Werder Bremen - Eintracht Frankfurt 1:2
29. Round 11/05/1999 Werder Bremen - FC Schalke 04 1:0
32. Round 15/05/1999 TSV 1860 München - Werder Bremen 1:3
33. Round 22/05/1999 Werder Bremen - Bor. Mönchengladbach 4:1
34. Round 29/05/1999 VfB Stuttgart - Werder Bremen 1:0