1. Round 13/08/1999 Energie Cottbus - Fortuna Köln 2:0
2. Round 22/08/1999 Fortuna Köln - 1. FSV Mainz 05 2:1
3. Round 29/08/1999 1. FC Nürnberg - Fortuna Köln 2:1
4. Round 12/09/1999 Fortuna Köln - Chemnitzer FC 1:0
5. Round 19/09/1999 Hannover 96 - Fortuna Köln 3:1
6. Round 25/09/1999 Fortuna Köln - Karlsruher SC 2:3
7. Round 01/10/1999 Alemannia Aachen - Fortuna Köln 1:1
8. Round 15/10/1999 Fortuna Köln - FC St. Pauli 2:0
9. Round 25/10/1999 1. FC Köln - Fortuna Köln 3:0
10. Round 31/10/1999 Fortuna Köln - Rot-Weiß Oberhausen 0:0
11. Round 07/11/1999 SpVgg Greuther Fürth - Fortuna Köln 0:0
12. Round 19/11/1999 Fortuna Köln - Stuttgarter Kickers 1:1
13. Round 27/11/1999 VfL Bochum - Fortuna Köln 3:0 yellow card
14. Round 05/12/1999 Fortuna Köln - TeBe Berlin 0:0
15. Round 12/12/1999 Bor. Mönchengladbach - Fortuna Köln 0:0
16. Round 15/12/1999 Fortuna Köln - Waldhof Mannheim 1:5
17. Round 19/12/1999 Kickers Offenbach - Fortuna Köln 4:3
18. Round 13/02/2000 Fortuna Köln - Energie Cottbus 2:0
19. Round 20/02/2000 1. FSV Mainz 05 - Fortuna Köln 0:0
20. Round 27/02/2000 Fortuna Köln - 1. FC Nürnberg 1:1
21. Round 03/03/2000 Chemnitzer FC - Fortuna Köln 2:1
22. Round 12/03/2000 Fortuna Köln - Hannover 96 1:1 yellow card
23. Round 19/03/2000 Karlsruher SC - Fortuna Köln 2:1 yellow card
24. Round 26/03/2000 Fortuna Köln - Alemannia Aachen 0:0
25. Round 02/04/2000 FC St. Pauli - Fortuna Köln 0:0
26. Round 09/04/2000 Fortuna Köln - 1. FC Köln 4:1
27. Round 16/04/2000 Rot-Weiß Oberhausen - Fortuna Köln 4:0
28. Round 23/04/2000 Fortuna Köln - SpVgg Greuther Fürth 0:1 yellow card
29. Round 30/04/2000 Stuttgarter Kickers - Fortuna Köln 2:1
30. Round 06/05/2000 Fortuna Köln - VfL Bochum 2:3
31. Round 12/05/2000 TeBe Berlin - Fortuna Köln 1:2
32. Round 18/05/2000 Fortuna Köln - Bor. Mönchengladbach 1:2 red card