| 1. Round | 30/07/2000 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfB Stuttgart II | 3:2 | ||||
| 2. Round | 04/08/2000 | Kickers Offenbach | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | ||||
| 6. Round | 01/09/2000 | FC Carl Zeiss Jena | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:0 | ||||
| 10. Round | 28/09/2000 | SV 07 Elversberg | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | ||||
| 11. Round | 08/10/2000 | Rot-Weiß Erfurt | - | SV Darmstadt 98 | 1:0 | ||||
| 12. Round | 14/10/2000 | Wacker Burghausen | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | ||||
| 21. Round | 24/02/2001 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfR Aalen | 2:0 | ||||
| 23. Round | 10/03/2001 | Rot-Weiß Erfurt | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:0 |  |
|||
| 24. Round | 17/03/2001 | Sportfreunde Siegen | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:1 | ||||
| 22. Round | 23/03/2001 | SV Wehen-Taunusstein | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:1 | ||||
| 25. Round | 31/03/2001 | Rot-Weiß Erfurt | - | TSV 1860 München II | 4:0 | ||||
| 26. Round | 07/04/2001 | Karlsruher SC | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:3 | ||||
| 27. Round | 14/04/2001 | Rot-Weiß Erfurt | - | SV 07 Elversberg | 1:2 | ||||
| 30. Round | 05/05/2001 | Jahn Regensburg | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:2 |
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