1. Round 14/08/2006 FC Augsburg - 1. FC Köln 0:2
2. Round 20/08/2006 SC Paderborn 07 - FC Augsburg 1:0
3. Round 27/08/2006 FC Augsburg - Rot-Weiss Essen 0:0
4. Round 15/09/2006 SpVgg Unterhaching - FC Augsburg 0:1
5. Round 24/09/2006 FC Augsburg - Hansa Rostock 1:1
6. Round 01/10/2006 Karlsruher SC - FC Augsburg 3:2
8. Round 23/10/2006 TuS Koblenz - FC Augsburg 1:1
9. Round 27/10/2006 FC Augsburg - TSV 1860 München 3:0
10. Round 05/11/2006 Erzgebirge Aue - FC Augsburg 1:1 yellow card
11. Round 08/11/2006 FC Augsburg - SC Freiburg 2:0 yellow card
12. Round 12/11/2006 MSV Duisburg - FC Augsburg 3:0
13. Round 19/11/2006 FC Augsburg - Wacker Burghausen 1:0
14. Round 24/11/2006 1. FC Kaiserslautern - FC Augsburg 0:0
15. Round 03/12/2006 Kickers Offenbach - FC Augsburg 3:2 yellow card
16. Round 10/12/2006 FC Augsburg - Eintracht Braunschweig 0:0
18. Round 21/01/2007 1. FC Köln - FC Augsburg 1:1 yellow card
19. Round 30/01/2007 FC Augsburg - SC Paderborn 07 0:1
20. Round 04/02/2007 Rot-Weiss Essen - FC Augsburg 0:0
21. Round 09/02/2007 FC Augsburg - SpVgg Unterhaching 2:1
22. Round 18/02/2007 Hansa Rostock - FC Augsburg 2:2
23. Round 25/02/2007 FC Augsburg - Karlsruher SC 3:1
24. Round 02/03/2007 SpVgg Greuther Fürth - FC Augsburg 2:1
25. Round 09/03/2007 FC Augsburg - TuS Koblenz 2:0
26. Round 16/03/2007 TSV 1860 München - FC Augsburg 0:3
27. Round 01/04/2007 FC Augsburg - Erzgebirge Aue 3:0
28. Round 08/04/2007 SC Freiburg - FC Augsburg 2:0 yellow card
30. Round 22/04/2007 Wacker Burghausen - FC Augsburg 0:2
31. Round 29/04/2007 FC Augsburg - 1. FC Kaiserslautern 3:2
32. Round 04/05/2007 FC Augsburg - Kickers Offenbach 1:1
33. Round 13/05/2007 Eintracht Braunschweig - FC Augsburg 0:1
34. Round 20/05/2007 FC Augsburg - FC Carl Zeiss Jena 1:2 yellow card