| 20. Round | 24/02/2019 | Bayern München II | - | FC Ingolstadt 04 II | 3:0 | ||||
| 23. Round | 01/03/2019 | Bayern München II | - | SV Schalding-Heining | 5:1 | ||||
| 10. Round | 06/03/2019 | FC Augsburg II | - | Bayern München II | 0:3 | ||||
| 24. Round | 10/03/2019 | SpVgg Bayreuth | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 25. Round | 17/03/2019 | Bayern München II | - | VfR Garching | 3:2 |  |
|||
| 27. Round | 29/03/2019 | Bayern München II | - | FC Augsburg II | 0:1 | ||||
| 28. Round | 05/04/2019 | TSV Buchbach | - | Bayern München II | 1:2 | ||||
| 26. Round | 09/04/2019 | Viktoria Aschaffenburg | - | Bayern München II | 2:3 | ||||
| 29. Round | 15/04/2019 | Bayern München II | - | TSV 1860 Rosenheim | 1:1 | ||||
| 30. Round | 21/04/2019 | FC Memmingen | - | Bayern München II | 0:3 | ||||
| 31. Round | 26/04/2019 | Bayern München II | - | SV Heimstetten | 2:0 | ||||
| 32. Round | 06/05/2019 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 33. Round | 10/05/2019 | Bayern München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 3:1 |
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