| 23. Round | 07/02/2010 | SpVgg Unterhaching | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | ||||
| 25. Round | 20/02/2010 | Dynamo Dresden | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 26. Round | 27/02/2010 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 1:2 | ||||
| 22. Round | 09/03/2010 | Rot-Weiß Erfurt | - | FC Ingolstadt 04 | 2:1 | ||||
| 28. Round | 16/03/2010 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfB Stuttgart II | 0:1 | ||||
| 29. Round | 21/03/2010 | SV Wehen Wiesbaden | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:0 |  |
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| 30. Round | 27/03/2010 | Rot-Weiß Erfurt | - | SV Sandhausen | 1:0 | |
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| 31. Round | 31/03/2010 | Bayern München II | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 32. Round | 03/04/2010 | Rot-Weiß Erfurt | - | Erzgebirge Aue | 0:0 | |
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| 33. Round | 10/04/2010 | Jahn Regensburg | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:2 | ||||
| 35. Round | 18/04/2010 | Rot-Weiß Erfurt | - | Borussia Dortmund II | 1:0 | ||||
| 36. Round | 24/04/2010 | Holstein Kiel | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:2 | ||||
| 27. Round | 27/04/2010 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:3 |
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