| 12. Round | 25/10/2013 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC Ingolstadt 04 | 0:1 | ||||
| 14. Round | 08/11/2013 | FC Ingolstadt 04 | - | VfR Aalen | 2:0 | ||||
| 19. Round | 23/12/2013 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:2 | ||||
| 20. Round | 09/02/2014 | Karlsruher SC | - | FC Ingolstadt 04 | 1:1 |  |
|||
| 21. Round | 14/02/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | TSV 1860 München | 2:0 | ||||
| 22. Round | 21/02/2014 | Arminia Bielefeld | - | FC Ingolstadt 04 | 0:2 | ||||
| 23. Round | 02/03/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | Dynamo Dresden | 1:1 | |
|||
| 24. Round | 08/03/2014 | 1. FC Union Berlin | - | FC Ingolstadt 04 | 1:1 | |
|||
| 25. Round | 14/03/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | FSV Frankfurt | 0:1 | ||||
| 27. Round | 25/03/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | VfL Bochum | 3:0 | |
|||
| 28. Round | 28/03/2014 | Fortuna Düsseldorf | - | FC Ingolstadt 04 | 0:0 | ||||
| 29. Round | 07/04/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:0 | ||||
| 32. Round | 25/04/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Köln | 1:1 | ||||
| 33. Round | 04/05/2014 | SV Sandhausen | - | FC Ingolstadt 04 | 0:2 | ||||
| 34. Round | 11/05/2014 | FC Ingolstadt 04 | - | Energie Cottbus | 2:0 |
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