| 1. Round | 16/08/2008 | Eintracht Frankfurt II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:2 | ||||
| 2. Round | 23/08/2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SSV Reutlingen | 2:4 | ||||
| 20. Round | 18/03/2009 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:1 | ||||
| 23. Round | 21/03/2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 3:0 | ||||
| 27. Round | 24/04/2009 | SC Pfullendorf | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 4:2 | ||||
| 34. Round | 06/06/2009 | Waldhof Mannheim | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 0:0 |
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