| 1. Round | 12/08/2018 | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | - | SpVgg Unterhaching [Youth B] | 1:2 | ||||
| 21. Round | 31/03/2019 | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | - | VfB Stuttgart [Youth B] | 0:3 | ||||
| 22. Round | 06/04/2019 | 1. FC Heidenheim 1846 [Youth B] | - | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | 0:1 | ||||
| 23. Round | 13/04/2019 | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | - | Karlsruher SC [Youth B] | 0:0 | ||||
| 24. Round | 28/04/2019 | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | - | Eintracht Frankfurt [Youth B] | 0:1 |  |
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| 25. Round | 25/05/2019 | Bayern München [Youth B] | - | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | 4:2 | ||||
| 26. Round | 01/06/2019 | FC Ingolstadt 04 [Youth B] | - | SV Wehen Wiesbaden [Youth B] | 0:1 |
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