| 2. Round | 08/08/2007 | 1. FC Magdeburg | - | Energie Cottbus II | 1:1 | ||||
| 3. Round | 14/08/2007 | Hamburger SV II | - | 1. FC Magdeburg | 0:0 | ||||
| 4. Round | 19/08/2007 | 1. FC Magdeburg | - | Dynamo Dresden | 1:0 | ||||
| 1. Round | 22/08/2007 | Werder Bremen II | - | 1. FC Magdeburg | 3:0 | ||||
| 5. Round | 26/08/2007 | SC Verl | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 16. Round | 04/11/2007 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FC Magdeburg | 4:1 | ||||
| 18. Round | 17/11/2007 | Rot-Weiss Essen | - | 1. FC Magdeburg | 2:0 | ||||
| 19. Round | 24/11/2007 | 1. FC Magdeburg | - | Wuppertaler SV | 2:0 | ||||
| 20. Round | 01/12/2007 | 1. FC Magdeburg | - | Werder Bremen II | 1:1 | ||||
| 21. Round | 08/12/2007 | Energie Cottbus II | - | 1. FC Magdeburg | 2:1 | ||||
| 23. Round | 23/02/2008 | Dynamo Dresden | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 |  |
|||
| 28. Round | 29/03/2008 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 |  |
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| 29. Round | 05/04/2008 | 1. FC Magdeburg | - | Rot Weiss Ahlen | 2:2 | |
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| 30. Round | 13/04/2008 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 31. Round | 18/04/2008 | 1. FC Magdeburg | - | Kickers Emden | 1:3 | ||||
| 33. Round | 03/05/2008 | 1. FC Magdeburg | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 |
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