1. Round 29/07/2000 Jahn Regensburg - 1. FC Schweinfurt 05 1:1 yellow card
2. Round 05/08/2000 VfR Aalen - Jahn Regensburg 5:0
3. Round 12/08/2000 Jahn Regensburg - SV Wehen-Taunusstein 2:0
4. Round 16/08/2000 FC Carl Zeiss Jena - Jahn Regensburg 2:0
5. Round 26/08/2000 Jahn Regensburg - Sportfreunde Siegen 3:0
6. Round 02/09/2000 TSV 1860 München II - Jahn Regensburg 2:2
7. Round 09/09/2000 Jahn Regensburg - Karlsruher SC 3:1
8. Round 15/09/2000 SV 07 Elversberg - Jahn Regensburg 3:3 Goal
9. Round 23/09/2000 Jahn Regensburg - SV Darmstadt 98 3:2
10. Round 30/09/2000 Wacker Burghausen - Jahn Regensburg 2:1
11. Round 06/10/2000 SC Pfullendorf - Jahn Regensburg 4:2
12. Round 14/10/2000 Jahn Regensburg - Eintracht Trier 2:3
13. Round 21/10/2000 Rot-Weiß Erfurt - Jahn Regensburg 2:4 Goal
14. Round 28/10/2000 Jahn Regensburg - Bayern München II 6:1
15. Round 04/11/2000 VfR Mannheim - Jahn Regensburg 2:1
17. Round 17/11/2000 Kickers Offenbach - Jahn Regensburg 0:1
18. Round 25/11/2000 1. FC Schweinfurt 05 - Jahn Regensburg 3:1 yellow card
19. Round 02/12/2000 Jahn Regensburg - VfR Aalen 1:2
20. Round 09/12/2000 SV Wehen-Taunusstein - Jahn Regensburg 0:0
23. Round 10/03/2001 Jahn Regensburg - TSV 1860 München II 1:1
24. Round 17/03/2001 Karlsruher SC - Jahn Regensburg 2:0
22. Round 24/03/2001 Sportfreunde Siegen - Jahn Regensburg 2:0
25. Round 31/03/2001 Jahn Regensburg - SV 07 Elversberg 3:0
26. Round 07/04/2001 SV Darmstadt 98 - Jahn Regensburg 3:1
28. Round 20/04/2001 Jahn Regensburg - SC Pfullendorf 2:0
29. Round 28/04/2001 Eintracht Trier - Jahn Regensburg 1:2
30. Round 05/05/2001 Jahn Regensburg - Rot-Weiß Erfurt 1:2
31. Round 13/05/2001 Bayern München II - Jahn Regensburg 0:2
32. Round 19/05/2001 Jahn Regensburg - VfR Mannheim 3:2
33. Round 23/05/2001 VfB Stuttgart II - Jahn Regensburg 4:2
34. Round 26/05/2001 Jahn Regensburg - Kickers Offenbach 1:4