| 7. Round | 13/09/2003 | VfR Neumünster | - | Borussia Dortmund II | 1:2 | ||||
| 9. Round | 26/09/2003 | Eintracht Braunschweig | - | Borussia Dortmund II | 0:1 | ||||
| 10. Round | 04/10/2003 | Borussia Dortmund II | - | SG Wattenscheid 09 | 0:2 | ||||
| 13. Round | 25/10/2003 | Wuppertaler SV | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 15. Round | 08/11/2003 | Holstein Kiel | - | Borussia Dortmund II | 3:1 | ||||
| 17. Round | 22/11/2003 | Chemnitzer FC | - | Borussia Dortmund II | 0:2 | ||||
| 24. Round | 27/03/2004 | Borussia Dortmund II | - | VfR Neumünster | 1:2 | ||||
| 27. Round | 17/04/2004 | SG Wattenscheid 09 | - | Borussia Dortmund II | 3:0 | ||||
| 29. Round | 02/05/2004 | Dynamo Dresden | - | Borussia Dortmund II | 3:1 | ||||
| 32. Round | 22/05/2004 | Borussia Dortmund II | - | Holstein Kiel | 2:0 | ||||
| 34. Round | 05/06/2004 | Borussia Dortmund II | - | Chemnitzer FC | 0:2 |
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