| 2. Round | 02/08/2006 | SpVgg Weiden | - | 1. FC Nürnberg II | 1:0 |  |
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| 3. Round | 06/08/2006 | 1. FC Nürnberg II | - | 1. FC Bad Kötzting | 1:1 | ||||
| 4. Round | 11/08/2006 | TSV Großbardorf | - | 1. FC Nürnberg II | 2:2 |  |
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| 5. Round | 15/08/2006 | 1. FC Nürnberg II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 1:1 | |
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| 6. Round | 19/08/2006 | FC Memmingen | - | 1. FC Nürnberg II | 1:0 | ||||
| 15. Round | 13/10/2006 | SC Fürstenfeldbruck | - | 1. FC Nürnberg II | 1:0 |
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