| 2. Round | 11/08/2012 | SSV Ulm 1846 | - | Eintracht Frankfurt II | 0:2 |  |
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| 3. Round | 17/08/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | 1899 Hoffenheim II | 0:5 | ||||
| 4. Round | 22/08/2012 | Eintracht Trier | - | Eintracht Frankfurt II | 1:2 | ||||
| 5. Round | 25/08/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | SC Pfullendorf | 4:2 |  |
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| 6. Round | 01/09/2012 | SC Freiburg II | - | Eintracht Frankfurt II | 3:1 | ||||
| 7. Round | 04/09/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:1 | ||||
| 8. Round | 08/09/2012 | FC 08 Homburg | - | Eintracht Frankfurt II | 3:2 | |
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| 10. Round | 23/09/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | FSV Frankfurt II | 0:1 | |
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| 11. Round | 28/09/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | SC 07 Idar-Oberstein | 0:2 | |
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| 12. Round | 05/10/2012 | Wormatia Worms | - | Eintracht Frankfurt II | 3:1 | |
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| 15. Round | 28/10/2012 | TuS Koblenz | - | Eintracht Frankfurt II | 2:0 | |
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| 16. Round | 02/11/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | Hessen Kassel | 1:3 | |
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| 18. Round | 16/11/2012 | Eintracht Frankfurt II | - | Bayern Alzenau | 0:1 |
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