| 2. Round | 10/08/2024 | SpVgg Unterhaching | - | FC Ingolstadt 04 | 2:1 | ||||
| 3. Round | 24/08/2024 | 1. FC Saarbrücken | - | FC Ingolstadt 04 | 2:3 | ||||
| 4. Round | 31/08/2024 | FC Ingolstadt 04 | - | TSV 1860 München | 1:2 | ||||
| 5. Round | 14/09/2024 | VfB Stuttgart II | - | FC Ingolstadt 04 | 3:2 | ||||
| 6. Round | 21/09/2024 | FC Ingolstadt 04 | - | Rot-Weiss Essen | 2:2 | ||||
| 7. Round | 24/09/2024 | SV Sandhausen | - | FC Ingolstadt 04 | 4:3 | ||||
| 8. Round | 29/09/2024 | FC Ingolstadt 04 | - | Hansa Rostock | 2:1 | ||||
| 12. Round | 25/10/2024 | FC Ingolstadt 04 | - | Borussia Dortmund II | 5:3 | ||||
| 14. Round | 10/11/2024 | Hannover 96 II | - | FC Ingolstadt 04 | 0:4 | ||||
| 24. Round | 15/02/2025 | FC Ingolstadt 04 | - | VfB Stuttgart II | 1:1 | ||||
| 36. Round | 04/05/2025 | Erzgebirge Aue | - | FC Ingolstadt 04 | 1:0 | ||||
| 37. Round | 10/05/2025 | FC Ingolstadt 04 | - | SV Wehen Wiesbaden | 2:3 |
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