| 1. Round | 04/08/2013 | VfL Wolfsburg II | - | FC St. Pauli II | 4:0 | ||||
| 2. Round | 11/08/2013 | Goslarer SC | - | VfL Wolfsburg II | 1:1 | ||||
| 3. Round | 18/08/2013 | VfL Wolfsburg II | - | Eintracht Norderstedt | 2:0 | ||||
| 4. Round | 25/08/2013 | Schwarz-Weiß Rehden | - | VfL Wolfsburg II | 1:4 |  |
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| 5. Round | 01/09/2013 | VfL Wolfsburg II | - | SV Meppen | 1:2 | ||||
| 6. Round | 08/09/2013 | SV Eichede | - | VfL Wolfsburg II | 0:6 | ||||
| 7. Round | 15/09/2013 | VfL Wolfsburg II | - | Eintracht Braunschweig II | 4:0 | ||||
| 8. Round | 22/09/2013 | VfB Oldenburg | - | VfL Wolfsburg II | 2:1 | |
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| 12. Round | 20/10/2013 | TSV Havelse | - | VfL Wolfsburg II | 0:1 | ||||
| 14. Round | 03/11/2013 | VfL Wolfsburg II | - | VfR Neumünster | 0:3 | |
|||
| 15. Round | 10/11/2013 | SV Wilhelmshaven | - | VfL Wolfsburg II | 0:2 | ||||
| 16. Round | 17/11/2013 | VfL Wolfsburg II | - | Hannover 96 II | 2:1 | |
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| 17. Round | 23/11/2013 | Hamburger SV II | - | VfL Wolfsburg II | 3:3 | ||||
| 18. Round | 30/11/2013 | FC St. Pauli II | - | VfL Wolfsburg II | 0:1 |
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