| 1. Round | 07/08/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | SV Lichtenberg 47 | 0:5 | ||||
| 2. Round | 14/08/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | SV Grün-Weiß Brieselang | 1:1 | ||||
| 3. Round | 26/08/2016 | Hertha Zehlendorf | - | 1. FC Frankfurt (Oder) | 5:1 | ||||
| 4. Round | 10/09/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | SV Altlüdersdorf | 0:0 |  |
|||
| 6. Round | 25/09/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | CFC Hertha 06 | 2:4 | ||||
| 8. Round | 16/10/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | VSG Altglienicke | 0:3 | |
|||
| 9. Round | 22/10/2016 | Optik Rathenow | - | 1. FC Frankfurt (Oder) | 7:1 | |
|||
| 10. Round | 29/10/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | Malchower SV 90 | 1:2 | ||||
| 11. Round | 04/11/2016 | TeBe Berlin | - | 1. FC Frankfurt (Oder) | 2:3 | ||||
| 12. Round | 20/11/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | Victoria Seelow | 0:3 | ||||
| 13. Round | 27/11/2016 | Hansa Rostock II | - | 1. FC Frankfurt (Oder) | 3:2 | ||||
| 14. Round | 04/12/2016 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | FC Strausberg | 1:1 | ||||
| 15. Round | 10/12/2016 | FC Mecklenburg Schwerin | - | 1. FC Frankfurt (Oder) | 2:0 | |
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