1. Round 02/08/1998 1. FC Kaiserslautern II - SC Paderborn 07 2:1
3. Round 16/08/1998 SC Paderborn 07 - Sportfreunde Siegen 0:0
4. Round 23/08/1998 FC Remscheid - SC Paderborn 07 1:4 Goal
5. Round 30/08/1998 SC Paderborn 07 - Alemannia Aachen 2:0
6. Round 06/09/1998 FSV Salmrohr - SC Paderborn 07 1:1 yellow card
7. Round 13/09/1998 SC Paderborn 07 - FC 08 Homburg 3:0
8. Round 20/09/1998 Bayer Leverkusen II - SC Paderborn 07 0:1
9. Round 27/09/1998 SC Paderborn 07 - SC Verl 2:2 yellow card
10. Round 04/10/1998 SV 07 Elversberg - SC Paderborn 07 3:0
11. Round 10/10/1998 SC Paderborn 07 - Preußen Münster 1:3
12. Round 18/10/1998 SpVgg Erkenschwick - SC Paderborn 07 0:6
13. Round 25/10/1998 SC Paderborn 07 - Wuppertaler SV 1:0
15. Round 08/11/1998 SC Paderborn 07 - Eintracht Trier 2:1 yellow card
16. Round 15/11/1998 Borussia Dortmund II - SC Paderborn 07 0:3 yellow card
14. Round 21/11/1998 LR Ahlen - SC Paderborn 07 3:1
21. Round 21/02/1999 SC Paderborn 07 - FC Remscheid 3:0
22. Round 28/02/1999 Alemannia Aachen - SC Paderborn 07 2:3 yellow card
23. Round 07/03/1999 SC Paderborn 07 - FSV Salmrohr 2:1
24. Round 14/03/1999 FC 08 Homburg - SC Paderborn 07 1:1
25. Round 21/03/1999 SC Paderborn 07 - Bayer Leverkusen II 3:0
26. Round 28/03/1999 SC Verl - SC Paderborn 07 2:1
18. Round 01/04/1999 SC Paderborn 07 - 1. FC Kaiserslautern II 1:1
27. Round 11/04/1999 SC Paderborn 07 - SV 07 Elversberg 2:0 yellow card
28. Round 18/04/1999 Preußen Münster - SC Paderborn 07 1:1 Goal
29. Round 25/04/1999 SC Paderborn 07 - SpVgg Erkenschwick 0:0
30. Round 02/05/1999 Wuppertaler SV - SC Paderborn 07 4:0 yellow card
31. Round 09/05/1999 SC Paderborn 07 - LR Ahlen 0:2 yellow card
32. Round 16/05/1999 Eintracht Trier - SC Paderborn 07 5:0
33. Round 24/05/1999 SC Paderborn 07 - Borussia Dortmund II 2:1
34. Round 30/05/1999 1. FC Saarbrücken - SC Paderborn 07 1:1