| 1. Round | 20/07/2019 | 1. FC Magdeburg | - | Eintracht Braunschweig | 2:4 | ||||
| 2. Round | 28/07/2019 | FSV Zwickau | - | 1. FC Magdeburg | 0:0 | ||||
| 15. Round | 10/11/2019 | Bayern München II | - | 1. FC Magdeburg | 2:1 | ||||
| 20. Round | 21/12/2019 | Eintracht Braunschweig | - | 1. FC Magdeburg | 2:2 | ||||
| 27. Round | 06/03/2020 | MSV Duisburg | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 29. Round | 02/06/2020 | Würzburger Kickers | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 31. Round | 09/06/2020 | Hansa Rostock | - | 1. FC Magdeburg | 3:1 |
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