| 2. Round | 06/08/2016 | VfL Wolfsburg II | - | Schwarz-Weiß Rehden | 4:1 | ||||
| 4. Round | 20/08/2016 | Lüneburger SK Hansa | - | Schwarz-Weiß Rehden | 3:1 |  |
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| 5. Round | 27/08/2016 | Schwarz-Weiß Rehden | - | Eintracht Norderstedt | 2:0 | ||||
| 7. Round | 09/09/2016 | Schwarz-Weiß Rehden | - | Hamburger SV II | 0:2 | |
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| 8. Round | 18/09/2016 | SV Eichede | - | Schwarz-Weiß Rehden | 1:2 |  |
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| 10. Round | 01/10/2016 | U.S.I. Lupo-Martini | - | Schwarz-Weiß Rehden | 1:0 | ||||
| 12. Round | 16/10/2016 | ETSV Weiche Flensburg | - | Schwarz-Weiß Rehden | 2:0 | ||||
| 13. Round | 22/10/2016 | Schwarz-Weiß Rehden | - | TSV Havelse | 1:1 | |
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| 14. Round | 29/10/2016 | Schwarz-Weiß Rehden | - | VfV Hildesheim | 0:1 | ||||
| 16. Round | 12/11/2016 | Schwarz-Weiß Rehden | - | FC St. Pauli II | 1:3 |
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