| 2. Round | 10/09/2016 | FC Ingolstadt 04 | - | Hertha BSC | 0:2 | ||||
| 4. Round | 20/09/2016 | FC Ingolstadt 04 | - | Eintracht Frankfurt | 0:2 | ||||
| 12. Round | 26/11/2016 | FC Ingolstadt 04 | - | VfL Wolfsburg | 1:1 | ||||
| 17. Round | 21/01/2017 | FC Schalke 04 | - | FC Ingolstadt 04 | 1:0 | ||||
| 19. Round | 04/02/2017 | Hertha BSC | - | FC Ingolstadt 04 | 1:0 | ||||
| 32. Round | 06/05/2017 | FC Ingolstadt 04 | - | Bayer Leverkusen | 1:1 |
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