| 1. Round | 17/07/2016 | FC Pipinsried | - | 1. FC Sonthofen | 0:1 | ||||
| 2. Round | 20/07/2016 | 1. FC Sonthofen | - | TSV Landsberg | 2:0 | ||||
| 3. Round | 23/07/2016 | TSV 1883 Bogen | - | 1. FC Sonthofen | 1:1 | ||||
| 4. Round | 30/07/2016 | 1. FC Sonthofen | - | FC Unterföhring | 0:2 |  |
|||
| 5. Round | 03/08/2016 | SV Pullach | - | 1. FC Sonthofen | 4:3 | ||||
| 12. Round | 17/09/2016 | 1. FC Sonthofen | - | TSV Schwabmünchen | 5:1 | ||||
| 13. Round | 24/09/2016 | FC Ismaning | - | 1. FC Sonthofen | 1:1 |  |
 |
||
| 14. Round | 01/10/2016 | 1. FC Sonthofen | - | BCF Wolfratshausen | 1:2 | ||||
| 15. Round | 08/10/2016 | DJK Vilzing | - | 1. FC Sonthofen | 1:0 | ||||
| 16. Round | 15/10/2016 | TSV Kottern-St. Mang | - | 1. FC Sonthofen | 2:2 | ||||
| 17. Round | 22/10/2016 | 1. FC Sonthofen | - | SV Heimstetten | 2:1 | ||||
| 18. Round | 29/10/2016 | 1. FC Sonthofen | - | FC Pipinsried | 1:2 | ||||
| 19. Round | 05/11/2016 | TSV Landsberg | - | 1. FC Sonthofen | 0:0 |
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