| 20. Round | 02/11/2012 | SV Heimstetten | - | VfL Frohnlach | 2:1 | ||||
| 26. Round | 03/03/2013 | 1. FC Nürnberg II | - | VfL Frohnlach | 3:0 | ||||
| 30. Round | 30/03/2013 | VfL Frohnlach | - | Bayern München II | 0:3 |  |
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| 32. Round | 13/04/2013 | VfL Frohnlach | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:0 | ||||
| 25. Round | 16/04/2013 | VfL Frohnlach | - | TSV 1860 Rosenheim | 3:1 |
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