| 3. Round | 24/07/2019 | FC Ingolstadt 04 II | - | SV Donaustauf | 5:2 | ||||
| 5. Round | 03/08/2019 | FC Ingolstadt 04 II | - | FC Pipinsried | 2:4 | ||||
| 6. Round | 10/08/2019 | TSV 1865 Dachau | - | FC Ingolstadt 04 II | 3:1 |  |
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| 7. Round | 17/08/2019 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV 1860 München II | 3:2 | |
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| 8. Round | 23/08/2019 | TSV Schwabmünchen | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:1 |  |
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| 11. Round | 14/09/2019 | SpVgg Hankofen-Hailing | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:1 | ||||
| 12. Round | 21/09/2019 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV Kottern-St. Mang | 2:2 | ||||
| 13. Round | 28/09/2019 | SV Pullach | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:2 | ||||
| 19. Round | 10/11/2019 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV Landsberg | 5:1 | ||||
| 20. Round | 16/11/2019 | SV Donaustauf | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:1 | ||||
| 22. Round | 30/11/2019 | FC Pipinsried | - | FC Ingolstadt 04 II | 3:1 |
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