1. Round 09/08/2009 Energie Cottbus - FC Augsburg 3:1
2. Round 16/08/2009 FC Augsburg - Rot-Weiß Oberhausen 2:2
3. Round 22/08/2009 Arminia Bielefeld - FC Augsburg 1:2
4. Round 30/08/2009 FC Augsburg - 1. FC Union Berlin 1:1
6. Round 20/09/2009 FC Augsburg - Hansa Rostock 5:2
7. Round 27/09/2009 FC Augsburg - TuS Koblenz 1:1
8. Round 03/10/2009 SC Paderborn 07 - FC Augsburg 2:2
9. Round 18/10/2009 FC Augsburg - Karlsruher SC 1:1
10. Round 23/10/2009 Rot Weiss Ahlen - FC Augsburg 1:3
11. Round 01/11/2009 FC Augsburg - Alemannia Aachen 0:1
12. Round 07/11/2009 SpVgg Greuther Fürth - FC Augsburg 4:5
13. Round 22/11/2009 FC Augsburg - FC St. Pauli 3:2
14. Round 28/11/2009 MSV Duisburg - FC Augsburg 2:2
15. Round 04/12/2009 FC Augsburg - FSV Frankfurt 2:0
16. Round 12/12/2009 TSV 1860 München - FC Augsburg 1:0
17. Round 21/12/2009 FC Augsburg - 1. FC Kaiserslautern 4:1
18. Round 17/01/2010 FC Augsburg - Energie Cottbus 3:1
19. Round 24/01/2010 Rot-Weiß Oberhausen - FC Augsburg 0:3
20. Round 30/01/2010 FC Augsburg - Arminia Bielefeld 3:1
21. Round 06/02/2010 1. FC Union Berlin - FC Augsburg 0:0
22. Round 14/02/2010 FC Augsburg - Fortuna Düsseldorf 2:0
23. Round 20/02/2010 Hansa Rostock - FC Augsburg 0:1
24. Round 27/02/2010 TuS Koblenz - FC Augsburg 0:1
25. Round 07/03/2010 FC Augsburg - SC Paderborn 07 3:0
26. Round 13/03/2010 Karlsruher SC - FC Augsburg 1:0
27. Round 20/03/2010 FC Augsburg - Rot Weiss Ahlen 3:1
28. Round 28/03/2010 Alemannia Aachen - FC Augsburg 4:0
29. Round 04/04/2010 FC Augsburg - SpVgg Greuther Fürth 1:1 yellow card
30. Round 12/04/2010 FC St. Pauli - FC Augsburg 3:0
31. Round 16/04/2010 FC Augsburg - MSV Duisburg 2:0
32. Round 25/04/2010 FSV Frankfurt - FC Augsburg 1:1
33. Round 02/05/2010 FC Augsburg - TSV 1860 München 1:0