| 23. Round | 20/03/1999 | VfR Mannheim | - | Bayern München II | 1:3 | ||||
| 24. Round | 27/03/1999 | Bayern München II | - | SC Neukirchen | 2:1 | ||||
| 27. Round | 17/04/1999 | FC Augsburg | - | Bayern München II | 2:1 | ||||
| 28. Round | 24/04/1999 | SSV Reutlingen | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 29. Round | 02/05/1999 | Bayern München II | - | SV Wehen-Taunusstein | 0:0 | ||||
| 30. Round | 07/05/1999 | Wacker Burghausen | - | Bayern München II | 0:0 |
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