| 3. Round | 09/09/1998 | 1. FC Nürnberg | - | Borussia Dortmund | 0:0 | ||||
| 4. Round | 13/09/1998 | Borussia Dortmund | - | VfL Bochum | 0:1 |  |
|||
| 5. Round | 19/09/1998 | Bayer Leverkusen | - | Borussia Dortmund | 3:1 | ||||
| 6. Round | 26/09/1998 | Borussia Dortmund | - | VfL Wolfsburg | 2:1 | ||||
| 7. Round | 04/10/1998 | Bayern München | - | Borussia Dortmund | 2:2 | |
|||
| 11. Round | 06/11/1998 | Werder Bremen | - | Borussia Dortmund | 1:1 | ||||
| 18. Round | 18/12/1998 | Borussia Dortmund | - | VfB Stuttgart | 3:0 | ||||
| 20. Round | 27/02/1999 | Borussia Dortmund | - | 1. FC Nürnberg | 3:0 | ||||
| 30. Round | 05/05/1999 | FC Schalke 04 | - | Borussia Dortmund | 1:1 | ||||
| 31. Round | 08/05/1999 | Borussia Dortmund | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:0 | ||||
| 32. Round | 15/05/1999 | Eintracht Frankfurt | - | Borussia Dortmund | 2:0 | ||||
| 33. Round | 22/05/1999 | Borussia Dortmund | - | TSV 1860 München | 3:1 | ||||
| 34. Round | 29/05/1999 | Bor. Mönchengladbach | - | Borussia Dortmund | 0:2 |
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