| 12. Round | 22/09/2006 | TSV Aindling | - | VfL Frohnlach | 1:1 | ||||
| 13. Round | 30/09/2006 | VfL Frohnlach | - | Würzburger FV | 4:2 |  |
|||
| 15. Round | 14/10/2006 | VfL Frohnlach | - | FC Ismaning | 2:3 | |
|||
| 16. Round | 21/10/2006 | SpVgg Bayreuth | - | VfL Frohnlach | 2:0 | ||||
| 21. Round | 25/11/2006 | VfL Frohnlach | - | SpVgg Bayern Hof | 0:1 | ||||
| 22. Round | 02/12/2006 | SpVgg Unterhaching II | - | VfL Frohnlach | 2:2 | ||||
| 23. Round | 09/12/2006 | VfL Frohnlach | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:1 | ||||
| 25. Round | 03/03/2007 | VfL Frohnlach | - | 1. FC Bad Kötzting | 3:2 | ||||
| 26. Round | 10/03/2007 | TSV Großbardorf | - | VfL Frohnlach | 2:0 | ||||
| 27. Round | 16/03/2007 | VfL Frohnlach | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 1:0 | ||||
| 29. Round | 31/03/2007 | VfL Frohnlach | - | 1. SC Feucht | 1:0 | ||||
| 30. Round | 07/04/2007 | SV Heimstetten | - | VfL Frohnlach | 2:1 | ||||
| 31. Round | 14/04/2007 | VfL Frohnlach | - | TSV Aindling | 0:3 | ||||
| 32. Round | 21/04/2007 | Würzburger FV | - | VfL Frohnlach | 0:2 | ||||
| 33. Round | 27/04/2007 | VfL Frohnlach | - | 1. FC Nürnberg II | 3:2 | ||||
| 35. Round | 11/05/2007 | VfL Frohnlach | - | SpVgg Bayreuth | 1:3 |
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