| 1. Round | 29/07/2000 | SV Babelsberg 03 | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 3. Round | 13/08/2000 | Fortuna Düsseldorf | - | Werder Bremen II | 1:1 | ||||
| 6. Round | 03/09/2000 | SV Wilhelmshaven | - | Werder Bremen II | 1:0 |  |
|||
| 9. Round | 24/09/2000 | Werder Bremen II | - | SC Verl | 1:2 | ||||
| 12. Round | 14/10/2000 | Lüneburger SK | - | Werder Bremen II | 4:0 | ||||
| 13. Round | 22/10/2000 | Werder Bremen II | - | 1. FC Union Berlin | 0:1 | ||||
| 14. Round | 28/10/2000 | SG Wattenscheid 09 | - | Werder Bremen II | 1:2 | ||||
| 16. Round | 11/11/2000 | TeBe Berlin | - | Werder Bremen II | 0:1 | ||||
| 18. Round | 25/11/2000 | Erzgebirge Aue | - | Werder Bremen II | 0:0 | ||||
| 20. Round | 09/12/2000 | Werder Bremen II | - | SV Babelsberg 03 | 4:4 | ||||
| 21. Round | 16/12/2000 | Preußen Münster | - | Werder Bremen II | 2:1 | ||||
| 29. Round | 31/03/2001 | Werder Bremen II | - | KFC Uerdingen 05 | 1:0 |
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