| 3. Round | 26/08/2016 | BSG Chemie Leipzig | - | VfL Halle 96 | 2:0 | ||||
| 5. Round | 18/09/2016 | VFC Plauen | - | VfL Halle 96 | 4:2 | ||||
| 7. Round | 01/10/2016 | SV SCHOTT Jena | - | VfL Halle 96 | 3:1 |  |
|||
| 9. Round | 22/10/2016 | Bischofswerdaer FV | - | VfL Halle 96 | 4:0 | ||||
| 13. Round | 26/11/2016 | VfL Halle 96 | - | BSG Wismut Gera | 0:2 | ||||
| 17. Round | 24/02/2017 | Askania Bernburg | - | VfL Halle 96 | 1:0 | ||||
| 19. Round | 12/03/2017 | SV Merseburg 99 | - | VfL Halle 96 | 1:0 | ||||
| 20. Round | 18/03/2017 | VfL Halle 96 | - | VFC Plauen | 1:1 | |
|||
| 21. Round | 31/03/2017 | Germania Halberstadt | - | VfL Halle 96 | 5:0 | |
|||
| 18. Round | 03/05/2017 | VfL Halle 96 | - | BSG Chemie Leipzig | 0:4 | ||||
| 26. Round | 06/05/2017 | Inter Leipzig | - | VfL Halle 96 | 2:2 | ||||
| 27. Round | 13/05/2017 | VfL Halle 96 | - | FSV Barleben | 1:1 |
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