| 13. Round | 16/11/2008 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Nürnberg | 0:3 | ||||
| 14. Round | 23/11/2008 | 1. FC Nürnberg | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:1 | ||||
| 15. Round | 28/11/2008 | VfL Osnabrück | - | 1. FC Nürnberg | 1:1 | ||||
| 16. Round | 08/12/2008 | 1. FC Nürnberg | - | Hansa Rostock | 4:0 | ||||
| 18. Round | 30/01/2009 | FC Augsburg | - | 1. FC Nürnberg | 0:0 | ||||
| 20. Round | 15/02/2009 | Alemannia Aachen | - | 1. FC Nürnberg | 6:2 |  |
|||
| 26. Round | 03/04/2009 | 1. FC Nürnberg | - | TuS Koblenz | 2:0 | ||||
| 27. Round | 09/04/2009 | Rot-Weiß Oberhausen | - | 1. FC Nürnberg | 0:3 | ||||
| 28. Round | 19/04/2009 | 1. FC Nürnberg | - | FC St. Pauli | 2:0 |  |
|||
| 30. Round | 03/05/2009 | 1. FC Nürnberg | - | FC Ingolstadt 04 | 1:0 | ||||
| 31. Round | 10/05/2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | 1. FC Nürnberg | 1:1 | ||||
| 32. Round | 13/05/2009 | 1. FC Nürnberg | - | VfL Osnabrück | 2:0 | |
|||
| 33. Round | 17/05/2009 | Hansa Rostock | - | 1. FC Nürnberg | 0:0 | ||||
| 34. Round | 24/05/2009 | 1. FC Nürnberg | - | TSV 1860 München | 2:1 |
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