| 8. Round | 09/10/2020 | Bor. Mönchengladbach II | - | 1. FC Köln II | 1:2 |  |
|||
| 9. Round | 18/10/2020 | 1. FC Köln II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 4:0 | ||||
| 10. Round | 21/10/2020 | FC Schalke 04 II | - | 1. FC Köln II | 3:0 | |
|||
| 14. Round | 07/11/2020 | VfB Homberg | - | 1. FC Köln II | 3:1 | ||||
| 16. Round | 21/11/2020 | Alemannia Aachen | - | 1. FC Köln II | 0:0 | ||||
| 17. Round | 25/11/2020 | FC Wegberg-Beeck | - | 1. FC Köln II | 0:4 | ||||
| 18. Round | 28/11/2020 | 1. FC Köln II | - | Sportfreunde Lotte | 2:0 | ||||
| 20. Round | 12/12/2020 | 1. FC Köln II | - | SC Wiedenbrück | 1:1 | ||||
| 23. Round | 23/01/2021 | 1. FC Köln II | - | Borussia Dortmund II | 0:3 | ||||
| 24. Round | 30/01/2021 | Rot Weiss Ahlen | - | 1. FC Köln II | 2:4 | ||||
| 25. Round | 06/02/2021 | 1. FC Köln II | - | SV Lippstadt 08 | 2:1 | ||||
| 27. Round | 20/02/2021 | 1. FC Köln II | - | Fortuna Köln | 1:2 | ||||
| 28. Round | 27/02/2021 | Preußen Münster | - | 1. FC Köln II | 3:2 | |
|||
| 29. Round | 06/03/2021 | 1. FC Köln II | - | Bor. Mönchengladbach II | 2:0 | ||||
| 30. Round | 13/03/2021 | Rot-Weiß Oberhausen | - | 1. FC Köln II | 3:2 | ||||
| 31. Round | 20/03/2021 | 1. FC Köln II | - | FC Schalke 04 II | 5:2 |
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